El ajuste al sector ferroviario es la modificación con mayor impacto logístico del paquete. La concesionaria Canadian Pacific Kansas City México (CPKC México) reportó ingresos de 2,711 millones de dólares canadienses en 2025; aplicar la nueva tasa de 3% elevaría el pago del derecho de vía a 81.33 millones de dólares canadienses anuales, frente a los 33.89 millones que implicaría la tasa de 1.25% vigente —una diferencia de 47.44 millones de dólares canadienses. Óscar Del Cueto, presidente de CPKC México, había señalado antes de la aprobación que el alza representa 'un incremento de 140%' y que podría derivar en mayor pago de derechos a costa de inversión en infraestructura.

Además del sector ferroviario, la ley contempla un incremento de 10% en las cuotas por uso del espacio aéreo mexicano, ajustes a derechos migratorios, consulares, sanitarios, ambientales y de telecomunicaciones, así como una reducción de 12% en cuotas de espectro radioeléctrico móvil. El dictamen fue enviado al Ejecutivo sin reservas aprobadas; la publicación en el DOF determina la entrada en vigor de los nuevos cobros a partir del 1 de enero de 2027.