El canal depende del agua dulce de los ríos que alimentan el Lago Gatún para operar sus esclusas; en septiembre, las autoridades señalaron que la cuenca hidrográfica recibió menos precipitaciones de las esperadas. La Administración Nacional Oceánica y Atmosférica (NOAA, por sus siglas en inglés) pronostica una probabilidad superior al 75% de que el evento El Niño de octubre a diciembre supere en intensidad episodios anteriores en el registro moderno, lo que elevaría el riesgo de nuevas restricciones en la temporada seca de diciembre 2026 a abril 2027. Durante el primer semestre fiscal de 2026, la ACP reportó 6,288 tránsitos, 224 más que en el mismo período del año anterior, con ingresos aproximadamente 8-10% superiores al primer semestre de 2025.
El recorte a 29.5 tránsitos diarios incrementa la competencia por las reservaciones de ranura —slot— y eleva el riesgo de colas, primas de subasta más altas e incertidumbre en programaciones. Las líneas navieras con servicios transpacíficos Asia-Costa Este de EE.UU. y las rutas entre China y Norteamérica son las más expuestas. La Autoridad de Información Industrial estima que la preocupación inmediata ya no es si se desarrolla la sequía, sino cuánto se deterioran las condiciones del embalse antes de la próxima temporada seca.